พิพิธภัณฑ์หลวงปู่คำดี ปภาโส ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 5 สิงหาคม พ.ศ. 2529 เพื่อระลึกถึงคุณความดีของพระครูญาณทัสสี (หลวงปู่คำดี ปภาโส) ซึ่งเป็นพระครูชั้นเอกฝ่ายวิปัสสนาธุระ ภายในพิพิธภัณฑ์ประดิษฐานรูปปั้นพระครูญาณทัสสีบนฐานบัวหินอ่อนที่ส่วนตะวันตกของอาคาร รูปปั้นหันหน้าไปทางทิศตะวันออก เบื้องหน้ารูปปั้นมีอัฐิของหลวงปู่อยู่ในพานแก้วครอบกระจกใสพร้อมด้วยเครื่องสักการะต่างๆ ด้านหลังรูปปั้นแขวนภาพถ่ายหลวงปู่คำดีไว้เหนือประตูด้านทิศตะวันตก มีการจัดแสดงวัตถุไว้ตามตู้ ดังนี้
ตู้จัดแสดงที่ 1 หรือตู้ด้านทิศตะวันตกเฉียงใต้จัดแสดงประวัติโดยย่อ เส้นผม อัฐิที่กลายเป็นพระธาตุ และพัดยศประกอบสมณศักดิ์ของหลวงปู่คำดี
     ตู้จัดแสดงที่ 2 หรือตู้ด้านทิศตะวันตกเฉียงเหนือจัดแสดงผ้าสบง จีวร สังฆาฏิ และผ้าอื่น ๆ ของหลวงปู่คำดี
     ตู้จัดแสดงที่ 3 หรือตู้ด้านทิศตะวันออกเฉียงเหนือจัดแสดงเครื่องอัฐบริขารสำหรับการออกธุดงค์ของหลวงปู่คำดี พร้อมทั้งพระบรมสารีริกธาตุและพระธาตุที่เชื่อว่าเป็นของพระพุทธเจ้าและพระพุทธสาวก เช่น พระโมคคัลลานะ พระสารีบุตร องคุลีมาล พระควัมปติ พระกัจจายะ พระพิมพาเถรี พระโชติยะ พระอนุรุทธ พระสีวลี เป็นต้น
     ตู้จัดแสดงที่ 4 หรือตู้ด้านทิศตะวันออกเฉียงใต้จัดแสดงเครื่องบริขารและสิ่งของเครื่องใช้ต่าง ๆ ของหลวงปู่คำดี เช่น กระติกน้ำร้อน กระเป๋า ช้อม ส้อม เข็ม ด้าย ปากกา แว่นตา ไฟฉาย รองเท้า ไม้เท้า กรรไกรตัดเล็บ เป็นต้น