เมื่อปี พ.ศ.2558 นายประภัสร์ จงสงวน ผู้ว่าการรถไฟฯขณะนั้น มีคำสั่งแต่งตั้ง ผศ.พิเศษ ดร.ศิริพงศ์ พฤทธิพันธุ์ เป็นประธานกรรมการจัดหารายได้เพื่อก่อตั้ง "พิพิธภัณฑ์รถไฟไทย" ได้ปรับปรุงอาคารมุขหน้าของสถานีรถไฟกรุงเทพด้านทิศตะวันตก ให้เป็น สำนักงานมูลนิธิรถไฟไทยและพิพิธภัณฑ์รถไฟไทย  โดยมีการจดทะเบียนจัดตั้งมูลนิธิเมื่อวันที่ 3 กรกฎาคม พ.ศ.2558 หลังจากนั้น จึงได้ดำเนินการอย่างเป็นทางการตั้งแต่วันที่ 21 ตุลาคม พ.ศ.2558 เป็นต้นมา โดยมี ผศ.พิเศษ ดร.ศิริพงศ์ พฤทธิพันธุ์ เป็นประธานมูลนิธิและอดีตผู้ว่าการรถไฟฯ 2 ท่าน คือ ศาสตราจารย์หิรัญ รดีศรี และ นายประภัสร์ จงสงวน พร้อมทั้งนายรักเกียรติ เลิศอุตสาหกูล เป็นที่ปรึกษามูลนิธิรถไฟไทย

มูลนิธิรถไฟไทย มีวัตถุประสงค์หลักในการจัดหาทุนเพื่อก่อตั้งและดำเนินกิจการพิพิธภัณฑ์รถไฟไทย ให้เป็นแหล่งเรียนรู้ ศึกษาแลกเปลี่ยน ค้นคว้า วิจัย การวิวัฒนาการและพัฒนากิจการขนส่งระบบทางรางตลอดจนสนับสนุน ส่งเสริมให้มีการนำวิทยาการขนส่งระบบทางรางเพิ่มมากขึ้น รวมทั้งให้ทุนและรางวัลสำหรับผู้ที่สนใจในการพัฒนาองค์ความรู้ทางวิทยาการขนส่งระบบทางราง

พิพิธภัณฑ์รถไฟไทย เปิดให้ผู้สนใจทั้งชาวไทยและชาวต่างชาติได้เข้ามาเยี่ยมชมและศึกษาค้นคว้า มีพื้นที่ 2 ชั้น คือ

• ชั้นบน จัดแสดงพระเก้าอี้ในสมัยรัชกาลที่ 7 , ภาพโปสเตอร์เตือนระวังภัยในการเดินรถไฟ และมีมุมจำลองบรรยากาศเหมือนอยู่บนรถไฟ ให้ผู้เข้าชมได้ถ่ายรูปเก็บไว้เป็นที่ระลึก
• ชั้นล่าง จัดแสดงเครื่องมือเครื่องใช้ในกิจการเดินรถไฟและกิจการโรงแรมรถไฟ ซึ่งเป็นของเก่า ทั้งที่มีการใช้งานและบางส่วนเลิกใช้งานแล้ว เช่น จานและโถกระเบื้องในสมัยรัชการลที่ 5 , เครื่องตราทางสะดวก, ลูกตราและห่วงตราทางสะดวก, ตั๋วรถไฟแข็ง, อุปกรณ์ในการประทับวันที่ลงบนตั๋ว, โคมตะเกียงให้สัญญาน, เครื่องส่งโทรเลข, เครื่องพิมพ์ดีด, นาฬิกาไขลาน, โทรศัพท์แบบหมุน , ตลอดจนม้านั่งที่ทำจากไม้หมอนปลดระวาง เป็นต้น
• ส่วนจำหน่ายของที่ระลึก ให้กับผู้ที่สนใจในการสะสมหรือมอบเป็นของขวัญของฝากในวาระต่างๆ เช่น กรอบรูป ตั๋วรถไฟ เสื้อยืด หมวก กระเป๋า แม่เหล็กติดตู้เย็น กล่องใส่นามบัตร พวงกุญแจ ที่ทับกระดาษ และอื่นๆอีกมากมาย